تعیین مارکرژن ها از طریق ترکیب رتبه بندی و خوشه بندی ژن ها
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
- نویسنده توحید جعفری کشکی
- استاد راهنما ابراهیم حاجی زاده فاطمه رهبری زاده
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1389
چکیده
ریزآرایه تکنولوژی پیچیده و مرکبی است که در زیست شناسی و طب کاربرد دارد. این تکنولوژی برای بررسی سطح بیان هزاران ژن بصورت همزمان کاربرد دارد. یک تراشه ی ریزآرایه شامل هزاران نقطه ی بسیار ریز از الیگونوکلئوتیدها به نام ویژگی ها می باشد. الیگونوکلئوتیدها توسط روبات در سطرها وستون ها آرایش یافته نصب می شوند. انتخاب تعداد کمتری از ویژگی ها یا ژن ها برای تشخیص و پیش بینی نتیجه ی یک بیماری در این راستا حایز اهمیت است. روش های مختلفی در متون ریزآرایه برای رسیدن به این هدف مورد استفاده قرار گرفته اند که خوشه بندی و کلاس بندی از پرکاربرد روش های مورد استفاده اند. ماشین بردارهای حمایتی، بیز خام و درخت تصمیم از جمله روش های کلاس بندی هستند که برای تخصیص بیمار به کلاس های مختلف بر اساس سطح بیان ژنی بکار می روند. خوشه بندی سلسله مراتبی متداول ترین روش برای تشخیص موارد مشابه مانند ژن هاست. در تحقیق حاضر از ترکیب این روش ها برای تعیین زیرکلاس های بیماری با تعداد ژن کمتر استفاده نمودیم. این ژن ها را "ژن های مارکر" می نامند. قبل از این کار از روش های فیلترینگ اطلاع حاصله، کای اسکوئر و relief-f برای انتخاب آگاهی بخش-ترین ژن ها استفاده نمودیم. سپس این ژن ها در مراحل بعدی مورد استفاده قرار گرفتند. مطالعه ی ما نشان داد که استفاده از روش ترکیبی برای انتخاب تعداد کمی از ژن ها بعنوان مارکر های یک بیماری یا زیرگروه های آن و کلاس بندی بر اساس این ژن ها منجر به دقت بالاتر این کلاس بندی می شود.
منابع مشابه
روش شناسی رتبه بندی های بین المللی دانشگاه ها
رتبه‌بندی بین‌المللی دانشگاه‌ها از سال 2003 با آغاز به کار رتبه‌بندی شانگهای (ARWU) کلید خورد. ذینفعان مختلف از جمله مسئولین آموزش عالی در مواجهه با تنوع شاخص‌ها و روش‌شناسی‌های رتبه‌بندی‌ها، لازم است تفسیر صحیحی از نتایج و محدودیت‌های رتبه‌بندی‌ها داشته باشند. محورهای مورد بررسی برای 7 رتبه‌بندی منتخب عبارت بوده‌اند از: اینکه رسالت و ماموریت رتبه‌بندی تجاری است یا غیرتجاری، و پژوهشی یا آموزشی؛...
متن کاملبهبود روش تحلیل پوششی داده ها به منظور خوشه بندی مشتریان اعتباری بانک ها
رقابت بین مدیران سازمان های صنعتی و خدماتی برای تامین نیازهای مالی و اعتباری خود از طریق دریافت تسهیلات بانکی به صورت روزانه در حال افزایش است. از طرف دیگر منابع مالی و اعتباری بانک‌ها و موسسات مالی برای ارائه تسهیلات به متقاضیان محدود می‌باشد. بر این اساس تخصیص بهینه منابع محدود مالی با هدف حداکثر نمودن ارزش سرمایه گذاری برای آنها یک ضرورت می-باشد. در این تحقیق پس از شناسایی معیارهای اعتباردهی...
متن کاملخوشه بندی و رتبه بندی پیمانکاران با استفاده از مدل های خوشه بندی و ویکور (مطالعه موردی: مسکن مهر شهر جدید هشتگرد)
مدیریت بر اجرای طرح های مسکن مهر که نیازمند سرعت عمل بسیار زیاد و در حجم گسترده است تنها با دریافت و پردازش صحیح و به موقع داده ها و اطلاعات قابل اعتماد محقق خواهد شد. برنامه ریزی های بلند مدت مدیران در تمامی سطوح پروژه های مسکن مهر که مسیر حرکت و نحوه ی عملکرد کلیه ی دست اندرکاران طرح مسکن مهر را تعیین می کند بر مبنای تحلیل داده های موجود انجام می شود. شرکت عمران شهر جدید هشتگرد به عنوان یکی ...
متن کاملکاهش بعد تصاویر فراطیفی از طریق خوشه بندی فازی باندها
این مقاله یک روش نوین جهت انتخاب باند از تصاویر فراطیفی از طریق خوشه بندی باندها ارائه می دهد. نوآوری اصلی این تحقیق در دو موضوع قرار می‌گیرد: الف- ارائه یک فضای محاسباتی جدید با نام فضای پدیده که در آن باندها بر اساس انعکاس طیفی پدیده ها دارای بردار مشخصه می‌شودد. ب- ارائه معیار هایی نظیر عدم قطعیت و زاویه در فضای پدیده برای شناسایی باندهای با وابستگی بالا و باندهای حاوی اطلاعات. پس از آنکه فض...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه تربیت مدرس - دانشکده علوم پزشکی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023